Цель программы – подготовка студентов-магистрантов к работе в полной общеобразовательной школе, в том числе на углубленном уровне обучения, разработка теоретических основ и практическая реализация модели интеграции содержания естественнонаучного образования, обеспечение образовательных интересов студентов, связанных с формированием личности современного педагога, его профессиональных знаний и умений в предметной области и исследовательской деятельности в сфере теории, методики естественнонаучного образования в современной общеобразовательной школе.

Поступающие на программу магистратуры обладают основными теоретическими знаниями по разделам методики обучения дисциплинам естественнонаучного цикла ( биологии, экологии и химии), методики их преподавания. Во время обучения студенты закрепляют знание теоретических и методических основ, изучают инновационные процессы в естественнонаучном образовании, биоразнообразие животных Средней Сибири и стратегии его сохранения, строение и свойства органических веществ, теоретические основы педагогического проектирования.

Практику магистрантов составляют: научно-исследовательская работа, технологическая (проектно-технологическая), ознакомительная, педагогическая, преддипломная практики. Магистранты имеют возможность публиковать свои научные статьи в сборнике научной конференции «География и геоэкология на службе науки и инновационного образования».

Университет предлагает возможности для осуществления научно-исследовательской деятельности студентов, для этого создан комплекс научно-образовательных центров и химических лабораторий. Большинство экспонатов, коллекций, музеев и гербариев собраны руками преподавателей и студентов. Богатства факультета - Зоологический музей, Музей геологии и землеведения Центральной Сибири, Гербарий КГПУ им. Л.М. Черепнина самого крупного в России по флоре Красноярского края и Хакасии. Студенты могут не только использовать экспонаты в учебных научных целях, но пополнять музеи в ходе научных полевых экспедиций и практик.

Подготовка специалистов, способных осуществлять исследовательскую деятельность и реализовывать образовательные программы по современным проблемам естествознания в системе основного общего, среднего общего и профессионального образования.

Выпускник может быть трудоустроен в должности учителя с правом преподавания естествознания, физики, биологии, химии, экологии в общеобразовательных организациях разного типа (в гимназиях, лицеях, школах с углубленным изучением предметов), преподавателем дисциплин естественнонаучного цикла в организациях среднего профессионального и высшего образования, педагога дополнительного образования, работника системы повышения квалификации профессионального (педагогического) образования.